FlashGet wird durch Kopieren der URL in die Zwischenablage geöffnet, wobei das Eigenschaften-Dialogfeld angezeigt wird. In dieses trägt man den Zielordner, einen Kommentar und die jeweilige Kategorie ein, in die die Datei gehören soll. FlashGet teilt die Downloads auch in mehrere Teile auf, um sie parallel downzuloaden und behält alle Urls im Speicher um evtl. vorhandene Updates durchzuführen.